La Biblioteca del Centro di Documentazione è stata costituita nel 2001 in alcuni locali dell'ex-ospedale di S. Giovanni di Dio appartenenti alla parte storica del complesso realizzata a seguito dell’ampliamento della struttura nosocomiale avvenuto tra il 1730 e il 1734.
Nella Biblioteca hanno trovato collocazione il fondo librario compreso tra i secoli XVIII - XX appartenente all’ospedale dismesso di San Francesco di Marradi; il fondo di letteratura scientifico- pediatrica dei primi anni Cinquanta del Novecento del Prof. Giuseppe Mya; il residuo librario della biblioteca proveniente dall’ospedale di Santa Maria Nuova con testi datati soprattutto 1600- 1800; il fondo storico costituito da libri e riviste del Dipartimento di Scienze Neurologiche e Psichiatriche dell’Università degli Studi di Firenze, nonché quei testi inerenti la storia della medicina e della sanità di ambito prettamente fiorentino e toscano che il Centro continua ad acquisire con il proposito di costituire un polo di consultazione specialistica a supporto ed integrazione delle presenze bibliotecarie di settore della città.

Di recente è stato acquisito dall’Istituto Nazionale di Previdenza Sociale di Empoli (in rapporto di comodato) l’ampia raccolta di testi di storia della medicina appartenenti alla donazione Nigrisoli che assomma a circa 1334 testi datati fine Ottocento- primi Cinquant’anni del Novecento.

Attualmente, sono consultabili sul Catalogo del Sistema Documentario Integrato dell’Area Metropolitana (SDIAF- Comune di Firenze) il fondo storico del Sette/Ottocento, la raccolta Miscellanea Fisico-Medica e il fondo di storia della sanità contemporaneo.

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